Plants : Sorghum bicolor

Transcripts

List of transcript names and their 3' Untranslated Region (3' UTR) sequence properties

Name pattern

Exact names (separated by rows):

Genome statistics

Sequence count
Genome total	36391
Filtered set	36391 (no filters used)
Correlation	0

View sequences in FASTA

Transcript name	Length	GC-Content	Nucleotide Concentration
Transcript name	Length	GC-Content	Adenine	Guanine	Cytosine	Thymine
EES15573	54	0.24	0.43	0.13	0.11	0.33
EES15665	483	0.42	0.23	0.23	0.19	0.35
EES15688	489	0.41	0.32	0.22	0.19	0.27
EES15700	529	0.6	0.16	0.31	0.28	0.24
EES15744	238	0.42	0.27	0.26	0.16	0.31
EES15780	140	0.31	0.36	0.19	0.12	0.32
EES15821	457	0.4	0.32	0.23	0.16	0.28
EES15873	376	0.48	0.26	0.24	0.23	0.27
EES16074	842	0.43	0.24	0.22	0.21	0.33
EES16159	221	0.4	0.25	0.2	0.2	0.35
EES16183	314	0.42	0.29	0.22	0.2	0.3
EES16382	242	0.36	0.31	0.19	0.16	0.33
EES16385	235	0.44	0.21	0.26	0.18	0.34
EES16463	290	0.41	0.35	0.17	0.24	0.24
EES16479	264	0.41	0.27	0.26	0.14	0.32
EES16521	199	0.42	0.25	0.24	0.19	0.33
EES16571	499	0.41	0.26	0.23	0.18	0.33
EES16584	339	0.36	0.31	0.2	0.15	0.33
EES16588	569	0.41	0.29	0.22	0.19	0.3
EES16614	547	0.45	0.21	0.22	0.23	0.33
EES16622	372	0.38	0.29	0.26	0.12	0.33
EES16691	441	0.41	0.26	0.23	0.19	0.33
EES16720	1116	0.41	0.3	0.22	0.18	0.3
EES16767	822	0.42	0.28	0.2	0.22	0.3
EES16808	383	0.31	0.33	0.18	0.13	0.35
EES16840	360	0.48	0.2	0.27	0.21	0.32
EES16842	587	0.48	0.25	0.24	0.24	0.27
EES17028	371	0.39	0.31	0.21	0.18	0.3
EES17383	534	0.37	0.3	0.24	0.13	0.34
KXG22801	299	0.4	0.26	0.24	0.16	0.34
KXG22825	389	0.45	0.21	0.27	0.17	0.34
KXG22925	1512	0.41	0.29	0.23	0.18	0.31
KXG23024	252	0.38	0.29	0.18	0.19	0.34
KXG23077	495	0.38	0.27	0.22	0.16	0.35
KXG23239	555	0.38	0.29	0.2	0.18	0.33
KXG23295	566	0.41	0.27	0.24	0.17	0.33
KXG23311	2058	0.37	0.27	0.19	0.17	0.36
KXG23339	42	0.43	0.26	0.21	0.21	0.31
KXG23538	2326	0.43	0.29	0.23	0.2	0.28
KXG23592	250	0.3	0.43	0.14	0.16	0.26
KXG23601	1299	0.39	0.29	0.2	0.19	0.31
KXG23724	523	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
KXG23725	490	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
KXG23726	512	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
KXG23727	534	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
KXG23728	523	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
KXG23729	513	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
KXG23793	1898	0.43	0.29	0.21	0.22	0.28
KXG23802	1352	0.42	0.29	0.21	0.21	0.29
KXG23863	551	0.44	0.24	0.24	0.2	0.32
KXG23940	843	0.43	0.24	0.22	0.21	0.33
KXG23976	412	0.44	0.25	0.24	0.2	0.31
KXG24064	285	0.4	0.24	0.2	0.21	0.36
KXG24066	285	0.4	0.24	0.2	0.21	0.36
OQU75661	109	0.34	0.24	0.25	0.09	0.42
OQU78641	5025	0.37	0.3	0.18	0.19	0.33
OQU78642	1973	0.36	0.29	0.19	0.17	0.35
OQU78665	269	0.41	0.23	0.25	0.16	0.36
OQU78681	58	0.6	0.21	0.26	0.34	0.19
OQU78752	287	0.52	0.24	0.24	0.27	0.24
OQU78776	246	0.38	0.29	0.18	0.2	0.33
OQU78804	234	0.37	0.29	0.2	0.17	0.34
OQU78806	3068	0.43	0.28	0.22	0.2	0.3
OQU78808	3046	0.43	0.27	0.22	0.2	0.3
OQU78809	3045	0.43	0.27	0.22	0.2	0.3
OQU78857	1183	0.47	0.26	0.26	0.21	0.27
OQU78874	2	0	1	0	0	0
OQU78882	306	0.32	0.33	0.17	0.15	0.35
OQU78899	431	0.39	0.28	0.23	0.16	0.32
OQU78901	430	0.39	0.28	0.23	0.16	0.32
OQU78902	430	0.39	0.28	0.23	0.16	0.32
OQU78903	430	0.39	0.28	0.23	0.16	0.32
OQU78904	430	0.39	0.28	0.23	0.16	0.32
OQU78931	555	0.38	0.29	0.2	0.18	0.33
OQU78937	6260	0.41	0.3	0.19	0.22	0.29
OQU78972	489	0.41	0.27	0.24	0.17	0.33
OQU78973	489	0.41	0.27	0.24	0.17	0.33
OQU79118	356	0.4	0.26	0.21	0.19	0.34
OQU79154	998	0.42	0.3	0.23	0.19	0.27
OQU79188	1534	0.42	0.3	0.22	0.2	0.28
OQU79224	723	0.38	0.29	0.18	0.2	0.33
OQU79227	723	0.38	0.29	0.18	0.2	0.33
OQU79228	1299	0.39	0.29	0.2	0.19	0.31
OQU79265	116	0.28	0.35	0.17	0.1	0.37
OQU79297	264	0.41	0.23	0.23	0.17	0.37
OQU79298	264	0.41	0.23	0.23	0.17	0.37
OQU79337	490	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
OQU79338	490	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
OQU79339	513	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
OQU79340	522	0.41	0.27	0.22	0.18	0.33
OQU79341	516	0.41	0.27	0.23	0.18	0.32
OQU79342	523	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
OQU79346	523	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
OQU79353	534	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
OQU79354	534	0.41	0.27	0.23	0.18	0.33
OQU79614	677	0.49	0.22	0.27	0.22	0.29
OQU79620	170	0.35	0.31	0.18	0.17	0.34
OQU79625	269	0.43	0.21	0.26	0.17	0.35
OQU79626	269	0.43	0.21	0.26	0.17	0.35
OQU79659	497	0.4	0.32	0.21	0.19	0.28
OQU79695	40	0.35	0.33	0.2	0.15	0.33

Sequence properties GO Gene Ontology Annotations CDS DataSeq distr Codon Usage AminoAcid Position Codon Position CDS Length CpG-Island in CDS GC-Content in CDS Nucleotide by Position in CDS Adenine in CDS Cytosine in CDS Guanine in CDS Thymine in CDS Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers CDNA DataCDNA Length CpG-Island in CDNA GC-Content in CNDA Nucleotide by Position in CDNA Adenine in CDNA Cytosine in CDNA Guanine in CDNA Thymine in CDNA Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers 5' UTR Data5' UTR Length CpG-Island in 5' UTR GC-Content in 5' UTR Nucleotide by Position in 5' UTR Adenine in 5' UTR Cytosine in 5' UTR Guanine in 5' UTR Thymine in 5' UTR Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers 3' UTR Data3' UTR Length CpG-Island in 3' UTR GC-Content in 3' UTR Nucleotide by Position in 3' UTR Adenine in 3' UTR Cytosine in 3' UTR Guanine in 3' UTR Thymine in 3' UTR Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers