Plants : Oryza sativa

Transcripts

List of gene names and their 5' Untranslated Region (5' UTR) sequence properties

Name pattern

Exact names (separated by rows):

Genome statistics

Sequence count
Genome total	35112
Filtered set	35112 (no filters used)
Correlation	0

View sequences in FASTA

Transcript name	Length	GC-Content	Nucleotide Concentration
Transcript name	Length	GC-Content	Adenine	Guanine	Cytosine	Thymine
Os01t0544450-01	25	0.68	0.08	0.28	0.4	0.24
Os01t0563000-01	187	0.5	0.3	0.25	0.25	0.2
Os01t0563000-02	144	0.49	0.31	0.24	0.25	0.2
Os01t0563000-03	143	0.49	0.31	0.24	0.24	0.2
Os01t0563000-04	48	0.56	0.31	0.29	0.27	0.13
Os01t0563000-05	2	0	1	0	0	0
Os01t0563000-06	1	0	0	0	0	1
Os01t0647700-01	333	0.6	0.17	0.25	0.35	0.23
Os01t0734100-01	179	0.63	0.21	0.28	0.35	0.17
Os01t0810300-01	83	0.59	0.2	0.18	0.41	0.2
Os01t0873800-01	87	0.7	0.23	0.4	0.3	0.07
Os01t0878400-01	74	0.69	0.15	0.24	0.45	0.16
Os01t0889800-01	51	0.57	0.16	0.27	0.29	0.27
Os01t0923000-01	76	0.55	0.16	0.18	0.37	0.29
Os01t0932500-01	100	0.64	0.11	0.22	0.42	0.25
Os01t0973300-01	1	1	0	1	0	0
Os02t0119400-01	155	0.63	0.31	0.26	0.37	0.06
Os02t0298100-01	1524	0.48	0.26	0.26	0.22	0.26
Os02t0671400-01	1330	0.46	0.24	0.22	0.25	0.29
Os02t0671400-02	154	0.75	0.16	0.37	0.38	0.1
Os02t0749900-01	80	0.75	0.13	0.28	0.48	0.13
Os02t0832400-01	185	0.62	0.19	0.35	0.26	0.19
Os02t0832400-02	137	0.65	0.17	0.39	0.26	0.18
Os03t0142900-01	161	0.66	0.23	0.46	0.2	0.11
Os03t0181550-00	2	1	0	0.5	0.5	0
Os03t0226800-01	244	0.66	0.14	0.24	0.42	0.2
Os03t0729000-01	69	0.46	0.39	0.17	0.29	0.14
Os03t0744200-01	2	1	0	0.5	0.5	0
Os03t0782300-01	950	0.56	0.19	0.26	0.3	0.25
Os04t0127800-01	68	0.68	0.1	0.18	0.5	0.22
Os04t0280251-00	2834	0.4	0.3	0.18	0.22	0.3
Os04t0452100-01	1714	0.49	0.23	0.25	0.24	0.28
Os04t0452100-02	401	0.51	0.29	0.27	0.23	0.2
Os04t0525900-01	237	0.76	0.12	0.44	0.31	0.12
Os04t0569300-01	112	0.52	0.25	0.2	0.32	0.23
Os04t0569300-02	80	0.54	0.24	0.21	0.33	0.23
Os04t0570125-00	391	0.48	0.25	0.23	0.26	0.27
Os04t0597700-01	650	0.65	0.2	0.32	0.33	0.16
Os04t0615500-01	517	0.5	0.17	0.21	0.29	0.32
Os04t0618100-01	279	0.47	0.24	0.23	0.24	0.29
Os04t0632750-00	882	0.4	0.29	0.18	0.22	0.31
Os04t0659200-01	1944	0.4	0.27	0.21	0.19	0.33
Os05t0127200-01	263	0.41	0.29	0.22	0.19	0.3
Os05t0127200-02	85	0.53	0.29	0.32	0.21	0.18
Os05t0167600-01	93	0.51	0.31	0.28	0.23	0.18
Os05t0400800-01	141	0.7	0.13	0.26	0.43	0.18
Os05t0433900-00	186	0.56	0.19	0.3	0.27	0.24
Os05t0592350-00	1	1	0	1	0	0
Os06t0102600-01	2	0.5	0.5	0.5	0	0
Os06t0141133-00	1	1	0	0	1	0
Os06t0225100-01	158	0.65	0.18	0.21	0.44	0.16
Os06t0225600-01	156	0.72	0.09	0.34	0.38	0.19
Os06t0230801-00	112	0.63	0.21	0.43	0.21	0.16
Os06t0237950-00	30	0.33	0.33	0.1	0.23	0.33
Os06t0251700-01	217	0.78	0.1	0.51	0.27	0.12
Os06t0303501-00	219	0.71	0.15	0.36	0.35	0.14
Os06t0488125-00	707	0.53	0.23	0.24	0.29	0.23
Os06t0492750-00	65	0.52	0.26	0.17	0.35	0.22
Os06t0520733-00	33	0.73	0.15	0.45	0.27	0.12
Os06t0528600-01	140	0.64	0.16	0.36	0.28	0.21
Os06t0571800-01	185	0.51	0.22	0.19	0.32	0.27
Os06t0571800-02	185	0.51	0.22	0.19	0.32	0.27
Os06t0571800-03	186	0.51	0.22	0.19	0.32	0.27
Os06t0608300-01	105	0.7	0.15	0.15	0.55	0.14
Os06t0608300-02	2	0.5	0.5	0.5	0	0
Os06t0662225-00	6	0.17	0.67	0	0.17	0.17
Os06t0707400-01	747	0.48	0.25	0.24	0.24	0.27
Os06t0707400-02	79	0.61	0.16	0.32	0.29	0.23
Os06t0731800-01	126	0.55	0.19	0.21	0.34	0.26
Os07t0176600-01	179	0.45	0.3	0.24	0.21	0.25
Os07t0544900-01	131	0.66	0.26	0.32	0.34	0.08
Os07t0546200-01	71	0.37	0.21	0.2	0.17	0.42
Os07t0593000-01	68	0.43	0.38	0.13	0.29	0.19
Os08t0260400-00	94	0.43	0.3	0.1	0.33	0.28
Os08t0265500-01	500	0.6	0.16	0.25	0.35	0.24
Os08t0359050-00	98	0.37	0.32	0.11	0.26	0.32
Os08t0471850-00	532	0.43	0.22	0.19	0.24	0.35
Os08t0485600-01	151	0.74	0.17	0.37	0.37	0.09
Os08t0485600-02	150	0.75	0.17	0.37	0.37	0.09
Os08t0538600-01	47	0.57	0.11	0.23	0.34	0.32
Os08t0549450-00	14	0.5	0.29	0.21	0.29	0.21
Os09t0347900-01	479	0.55	0.25	0.34	0.22	0.2
Os09t0427100-01	714	0.5	0.19	0.24	0.26	0.31
Os09t0465800-01	66	0.65	0.17	0.21	0.44	0.18
Os09t0482100-01	125	0.73	0.15	0.26	0.46	0.12
Os09t0494200-01	324	0.6	0.18	0.16	0.44	0.22
Os09t0494200-02	106	0.58	0.23	0.25	0.32	0.2
Os09t0508300-01	357	0.69	0.1	0.4	0.29	0.22
Os09t0521100-01	2	1	0	0.5	0.5	0
Os10t0108700-01	90	0.49	0.37	0.24	0.24	0.14
Os10t0108700-02	28	0.36	0.43	0.18	0.18	0.21
Os10t0534700-01	164	0.58	0.23	0.24	0.34	0.19
Os11t0594700-00	69	0.38	0.39	0.1	0.28	0.23
Os12t0124000-01	24	0.5	0.33	0.33	0.17	0.17
Os12t0124000-02	2	0	1	0	0	0
Os12t0124000-04	1	1	0	1	0	0
Os12t0141800-01	60	0.58	0.3	0.32	0.27	0.12
Os12t0190000-01	433	0.67	0.19	0.32	0.35	0.14
Os12t0190000-02	1	0	1	0	0	0
Os12t0248600-01	71	0.48	0.28	0.25	0.23	0.24
Os12t0568500-01	69	0.38	0.36	0.16	0.22	0.26

Sequence properties GO Gene Ontology Annotations CDS DataSeq distr Codon Usage AminoAcid Position Codon Position CDS Length CpG-Island in CDS GC-Content in CDS Nucleotide by Position in CDS Adenine in CDS Cytosine in CDS Guanine in CDS Thymine in CDS Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers CDNA DataCDNA Length CpG-Island in CDNA GC-Content in CNDA Nucleotide by Position in CDNA Adenine in CDNA Cytosine in CDNA Guanine in CDNA Thymine in CDNA Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers 5' UTR Data5' UTR Length CpG-Island in 5' UTR GC-Content in 5' UTR Nucleotide by Position in 5' UTR Adenine in 5' UTR Cytosine in 5' UTR Guanine in 5' UTR Thymine in 5' UTR Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers 3' UTR Data3' UTR Length CpG-Island in 3' UTR GC-Content in 3' UTR Nucleotide by Position in 3' UTR Adenine in 3' UTR Cytosine in 3' UTR Guanine in 3' UTR Thymine in 3' UTR Gene Names Transcript names Chromosome Strand Motifs K-Mers